漢代為姑墨、龜茲、溫宿諸國地，神爵三年(前59)隸西域都護府。
魏晉至隋為龜茲國地。
唐為龜茲都督府姑墨州、溫肅州，隸屬安西都護府。
北宋屬高昌回鶻，南宋屬西遼。
元、明屬別失八里，為蒙古宗王察合臺封地。
14世紀為東察合臺汗國轄境。
清乾隆二十四年(1759)設阿克蘇、烏什、庫車等辦事大臣。
光緒九年(1883)置阿克蘇道。
光緒二十八年(1902)轄溫宿府、焉耆府、庫車直隸州和烏什直隸廳。
1929年改阿克蘇道為阿克蘇行政區(qū)。
1930年從阿克蘇縣析置阿瓦提縣、柯坪縣。
1941年改為新和縣。
1943年阿克蘇行政區(qū)改為督察專區(qū)。
1944年由烏什縣析置阿合縣。
1950年成立阿克蘇專區(qū)。
1970年改專區(qū)為阿克蘇地區(qū)。