明永樂(lè)三年（1405）合東林、西林，改名雙林鎮(zhèn)。
1949年屬吳興縣稱(chēng)雙林鎮(zhèn)，同年秋撤鄉(xiāng)建區(qū)屬雙林區(qū)。
1950年春屬雙林區(qū)稱(chēng)雙林鎮(zhèn)。
1958年10月，雙林鎮(zhèn)稱(chēng)雙林人民公社。
1961年5月，經(jīng)嘉興地委批準(zhǔn)雙林鎮(zhèn)為吳興縣直屬鎮(zhèn)。
1967年10月至1969年9月，雙林組建革命委員會(huì)。
1975年雙林鎮(zhèn)成立區(qū)工委，下轄雙林鎮(zhèn)、苕南、莫蓉、鎮(zhèn)西、重兆、塘南6個(gè)社區(qū)。
1981年撤縣建市（撤吳興縣，建立湖州市），建立了各公社管理委員會(huì)和雙林鎮(zhèn)人民政府制度。
1983年撤嘉興專(zhuān)區(qū)，湖州市升格為地級(jí)市，實(shí)現(xiàn)市管縣（區(qū)）體制。
雙林屬郊區(qū)直管，郊區(qū)下設(shè)6個(gè)分區(qū)委，雙林分區(qū)委下轄雙林鎮(zhèn)、苕南、莫蓉、鎮(zhèn)西、重兆、塘南。
1984年實(shí)行行政社分設(shè)，公社管理委員會(huì)改為鄉(xiāng)政府，大隊(duì)改為村。
1993年撤小區(qū)建大區(qū)，撤南潯、雙林、練市三區(qū)，建立南潯區(qū)管理委員會(huì)。
同年苕南并入雙林鎮(zhèn)，雙林開(kāi)始?xì)w屬南潯區(qū)管理委員會(huì)管轄。
1999年鎮(zhèn)西、莫蓉二鄉(xiāng)并入雙林鎮(zhèn)。
2003年撤南潯區(qū)工委建立南潯區(qū)政府，雙林鎮(zhèn)屬南潯區(qū)政府管轄至今。