1950年屬邵甸區(qū)彩云鄉(xiāng)。
1951年5月與今侯家營村委會轄區(qū)合設(shè)高倉鄉(xiāng)。
1952年8月更名馬軍鄉(xiāng)。
1954年4月并入阿子營鄉(xiāng)，屬邵甸區(qū)。
1958年10月設(shè)立馬軍管理區(qū)。
1961年月改稱馬軍生產(chǎn)大隊，屬阿子營人民公社。
1963年3月，撤銷大隊，與原高倉大隊合設(shè)馬軍（小）公社，屬阿子營區(qū)。
1966年7月，高倉（侯家營）、馬軍分設(shè)大隊。
1984年3月改設(shè)馬軍鄉(xiāng)，屬阿子營區(qū)。
1987年1月改設(shè)馬軍辦事處。
2000年11月改設(shè)馬軍村民委員會，屬阿子營鄉(xiāng)。
2009年6月屬阿子營鎮(zhèn)。
2011年3月起屬阿子營街道。