秦代，隸屬匈奴，西漢納入漢朝版圖，漢、晉、南北朝時(shí)代，烏孫、柔然、高車先后在這里建立勢(shì)力范圍進(jìn)行游牧。
西魏至隋代，西突厥汗國(guó)建立。
唐朝時(shí)期，設(shè)瑤池都督府，匐延都督府，武則天時(shí)設(shè)北庭都護(hù)府，宋朝時(shí)代為西遼統(tǒng)治，十三世紀(jì)初，為窩闊臺(tái)汗國(guó)統(tǒng)治，1309年，今額敏一帶為察哈臺(tái)汗國(guó)領(lǐng)地，1628年，準(zhǔn)噶爾部落游牧地，1762年，歸伊犁將軍管轄。
清乾隆二十九年（1764）屬塔爾巴哈臺(tái)參贊大臣所轄；光緒十四年（1888）隸塔城直隸廳。
1918年，析塔城縣置額敏縣，先后隸屬塔城道、塔城行政區(qū)。
1949年，額敏縣設(shè)有5個(gè)農(nóng)業(yè)區(qū)和1個(gè)牧業(yè)區(qū)，即：一區(qū)（城鎮(zhèn)）、二區(qū)（上戶）、三區(qū)（烏什水）、四區(qū)（滿漢營(yíng)）、五區(qū)（瑪熱勒蘇、也木勒霍林蒙古區(qū)）；托里牧業(yè)區(qū)（現(xiàn)托里縣全境）。
1953年牧業(yè)改造時(shí)期，由額敏縣析置托里縣。
1958年成立人民公社，全縣又將5個(gè)區(qū)改為8個(gè)公社、六個(gè)農(nóng)牧場(chǎng)和一個(gè)城鎮(zhèn)，即：紅旗公社(郊區(qū)）、東風(fēng)公社（上戶）、十月公社（玉什喀拉蘇）、勝光公社（滿漢營(yíng)）、突擊公社（瑪熱勒蘇）、前進(jìn)公社（杰勒阿尕什）、后設(shè)庫(kù)魯木蘇公社、二道橋公社、（二道橋庫(kù)爾特）；農(nóng)牧場(chǎng)即：示范農(nóng)場(chǎng)（加爾布拉克）、機(jī)關(guān)農(nóng)場(chǎng)（闊什比克）、反修牧場(chǎng)（二支河）、紅星牧場(chǎng)（也木勒）、衛(wèi)星牧場(chǎng)（薩爾也木勒）、喇嘛昭煤礦牧場(chǎng)（柯?tīng)柨俗螏?kù)熱）。
1981年縣鎮(zhèn)成立了人民政府。
1984年政、社分設(shè)，共10個(gè)鄉(xiāng)、1個(gè)鎮(zhèn)、5個(gè)農(nóng)牧場(chǎng)。
10個(gè)鄉(xiāng)即：郊區(qū)鄉(xiāng)、上戶鄉(xiāng)、玉什喀拉蘇鄉(xiāng)、杰勒阿尕什鄉(xiāng)、瑪熱勒蘇鄉(xiāng)、二道橋鄉(xiāng)、霍吉爾特蒙古民族鄉(xiāng)、額瑪勒郭楞蒙古民族鄉(xiāng)、喀拉也木勒鄉(xiāng)、喇嘛昭鄉(xiāng)；1個(gè)鎮(zhèn)即：額敏鎮(zhèn)人民政府。
5個(gè)農(nóng)牧場(chǎng)即：也木勒牧場(chǎng)、薩爾也木勒牧場(chǎng)、二支河牧場(chǎng)、加爾布拉克農(nóng)場(chǎng)、闊什比克良種場(chǎng)。
2012年7月9日玉什喀拉蘇鄉(xiāng)變更為玉什喀拉蘇鎮(zhèn)、2012年7月15日杰勒阿尕什鄉(xiāng)變更為杰勒阿尕什鎮(zhèn)、2012年12月17日上戶鄉(xiāng)變更為上戶鎮(zhèn)，2013年9月10日瑪熱勒蘇鄉(xiāng)變更為瑪熱勒蘇鎮(zhèn)，2014年10月20日喀拉也木勒鄉(xiāng)變更為喀拉也木勒鎮(zhèn)。
2019年由139個(gè)行政村合并為119個(gè)行政村。