三教村清代屬桃鈕里；民國時期屬第三區(qū)南關編村管轄；1949年屬第二區(qū)（駐仁義）；1953年屬第二區(qū)吳莊鄉(xiāng)；1958年8月，中共中央作出《關于在農(nóng)村建立人民公社問題的決議》，我國全面開展人民公社化運動，實行政社合一、撤鄉(xiāng)建社，農(nóng)業(yè)生產(chǎn)合作社改稱為生產(chǎn)大隊；實行生產(chǎn)資料分別歸公社、生產(chǎn)大隊、生產(chǎn)隊三級組織所有的體制；1958年屬鋼鐵（南關）人民公社南關管理區(qū)；1961年為南關人民公社三教生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央、國務院聯(lián)合發(fā)出《關于實行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)鎮(zhèn)，建立鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）人民政府；同時，生產(chǎn)大隊改為村民委員會，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會。
靈石縣委、縣政府根據(jù)中共山西省委通知，在全縣進行基層政權體制改革，故將南關人民公社改為南關鎮(zhèn)，三教生產(chǎn)大隊改為三教村民委員會，1983年屬南關鎮(zhèn)管轄；2001年4月縣政府根據(jù)中辦發(fā)〔2000〕30號文件要求，經(jīng)市政府、省政府批準，靈石縣部分鄉(xiāng)鎮(zhèn)區(qū)劃進行調(diào)整，仁義鄉(xiāng)、西許鄉(xiāng)、富家灘鎮(zhèn)整體并入南關鎮(zhèn)，組建新的南關鎮(zhèn)，以原南關鎮(zhèn)、仁義鄉(xiāng)、西許鄉(xiāng)、富家灘鎮(zhèn)的行政區(qū)劃為現(xiàn)南關鎮(zhèn)的行政區(qū)劃。
故2001年至今三教村民委員會屬南關鎮(zhèn)管轄。