解放前屬太原縣四區(qū)，1948年解放后屬晉源縣，1949年屬太原第二專署，1951年4月，屬第六區(qū)下轄的一個自然村；1954年7月，第六區(qū)改制為晉源區(qū)。
1957年3月，撤銷晉源區(qū)成立郊區(qū)。
1960年6月，取消郊區(qū)級建制，建立市直轄的9個大公社，設立晉祠農(nóng)村人民公社，轄花塔生產(chǎn)大隊，1970年屬南郊區(qū)晉祠人民公社下轄的一個生產(chǎn)大隊，1984年撤銷晉祠人民公社設立晉祠鎮(zhèn)，改制為花塔村村民委員會，1997年設晉源區(qū)，花塔村村民委員會屬于晉源區(qū)晉祠鎮(zhèn)，一直沿用至今。