民國17年（1928），今萬集村境域屬江都縣大儀鄉(xiāng)高田村。
民國37年，屬東南縣甘泉區(qū)。
當年撤銷東南縣成立儀揚縣，境域屬儀揚甘泉區(qū)。
1949年，儀揚縣更名為儀征縣，屬儀征縣陳集區(qū)。
1955年，成立萬集初級社，1957年成立軍田高級社。
1957年3月，撤區(qū)并鄉(xiāng)，屬大儀鄉(xiāng)。
1959年2月，成立大儀人民公社，萬集大隊屬大儀公社。
1982年，萬集大隊分為萬集和軍田兩個大隊。
1983年，成立大儀鄉(xiāng)，地屬大儀鄉(xiāng)。
1996年，成立大儀鎮(zhèn)，地屬大儀鎮(zhèn)。
1999年3月，萬集和軍田兩個村合并為萬集村，設立萬集村村民委員會，沿用至今。