清朝康熙年間該地得名紅馬廟，屬谷城縣管轄。
民國(guó)初年屬由義區(qū)黃家營(yíng)村。
民國(guó)二十五年屬4區(qū)白果鄉(xiāng)。
民國(guó)三十三年屬石花鎮(zhèn)。
建國(guó)前夕屬石花區(qū)。
1949年隸屬第二區(qū)（石花區(qū)）管轄。
1951年6月，屬石花區(qū)白果鄉(xiāng)。
1955年初級(jí)社時(shí)取名紅旗社，1956年取名紅中社，屬縣轄白果樹(shù)鄉(xiāng)。
1958年人民公社化時(shí)期更名為紅中大隊(duì)，屬石花公社白果管理區(qū)。
1961年恢復(fù)區(qū)制，屬石花區(qū)白果公社。
1975年撤區(qū)并社，屬石花人民公社白果管理區(qū)。
1981年更名為紅馬廟大隊(duì)，屬石花鎮(zhèn)白果管理區(qū)。
1984年更名為紅馬廟村，屬石花鎮(zhèn)白果管理區(qū)。
1995年，屬石花鎮(zhèn)。
2002年與鐵匠溝村合并為紅馬廟村，屬石花鎮(zhèn)管轄至今。