民國時期屬均和鄉(xiāng),煙九鄉(xiāng),碧東鄉(xiāng)轄。
1949年10月屬煙店區(qū)轄。
1952年10月馮廟村屬安陸縣第五區(qū)煙店鄉(xiāng)轄。
1954年8月馮廟村屬青龍區(qū)煙店鄉(xiāng)轄。
1958年9月馮廟大隊屬紅旗人民公社煙店管理區(qū)轄。
1958年12月馮廟大隊屬青龍人民公社煙店管理區(qū)轄。
1961年4月屬青龍區(qū)煙店人民公社轄。
1966年9月屬紅旗區(qū)煙店人民公社轄。
1975年2月屬程巷人民公社煙店管理區(qū)轄。
1984年1月屬煙店區(qū)煙店鎮(zhèn)轄。
1987年10月馮廟村屬煙店鎮(zhèn)轄,沿用至今。