清屬北鄉(xiāng)北九都十甲。
1936年為靈源村、保德村，分屬界首鄉(xiāng)、會龍鄉(xiāng)。
1949年屬湘源區(qū)。
1950年為靈源鄉(xiāng)，屬湘漓區(qū)。
1952年屬興安縣第三區(qū)。
1958年改靈源大隊，屬上游公社。
1959年屬界首公社。
1961年屬會龍公社。
1962年改靈源公社，屬湘漓區(qū)。
1964年復改靈源大隊，屬湘漓公社。
1984年改靈源村，設靈源村民委員會，屬湘漓鄉(xiāng)。
1987年改靈源村公所。
1995年復設靈源村民委員會。
1999年屬湘漓鎮(zhèn)。
2017年更名靈源村村民委員會，沿用至今。