1543年立嶼仔村。
1950年屬六區(qū)大化鄉(xiāng)。
1952年由嶼仔、下山、屏風(fēng)山、東都、山邊、鳳來、溪山、金山八個(gè)自然村組成，設(shè)置嶼溪鄉(xiāng)。
1953年屬赤坑區(qū)。
1956年與高大鄉(xiāng)合并設(shè)置赤坑區(qū)高嶼鄉(xiāng)。
1958年設(shè)嶼溪大隊(duì)。
1978年由嶼溪大隊(duì)析出下山、屏風(fēng)山、東都、山邊、鳳來五個(gè)自然村組建東山大隊(duì)。
1984年東山大隊(duì)又并入嶼溪大隊(duì)改設(shè)赤坑區(qū)嶼溪鄉(xiāng)。
1987年改為嶼溪村委會。
1989年改為嶼溪管理區(qū)辦事處。
1998年改設(shè)為嶼仔村委會會。
后由嶼溪村委會析出，設(shè)嶼仔村委會，一直沿用至今。