民國初期，沿襲清制，武威縣的行政管理區(qū)按水系劃分為六個渠，即黃渠（黃羊河水系）、大渠（雜木河上游）、雜渠（雜木河下游）、金渠（金塔河水系）、懷渠（西營河上游）、永渠（西營河下游）。
民國24年（1935），將六個行政管理區(qū)劃分為2個鎮(zhèn)、12個鄉(xiāng)，屬西營鄉(xiāng)二保。
中華人民共和國成立初屬西營區(qū)馮良鄉(xiāng)，1956年撤區(qū)并鄉(xiāng)為柏樹鄉(xiāng)，1958年人民人民公社化屬金塔公社馮良大隊，1962年區(qū)劃調整后屬松樹公社，稱科畦大隊。
1983年撤社建鄉(xiāng)時，屬松樹鄉(xiāng)，設立科畦村民委員會，屬松樹鄉(xiāng)所轄。
2015年9月松樹鄉(xiāng)撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，屬松樹鎮(zhèn)。