明代前已形成村落，有下隘門、周家灣（甘草灣）、馬家山灣、孟家大灣。
明、清時(shí)屬永昌衛(wèi)（縣）寧遠(yuǎn)堡（北鄉(xiāng)）。
民國時(shí)為永昌縣寧遠(yuǎn)鄉(xiāng)（區(qū)）五保。
1949年解放初為永昌縣第四（寧遠(yuǎn)）區(qū)三鄉(xiāng)。
1952年屬永昌縣第五（寧遠(yuǎn)）區(qū)五（龍景）鄉(xiāng)。
1956年1月撤區(qū)并鄉(xiāng)屬永昌縣寧遠(yuǎn)堡鄉(xiāng)，當(dāng)年由三個(gè)初級(jí)農(nóng)業(yè)合作社并為紅旗高級(jí)農(nóng)業(yè)合作社。
1958年9月鄉(xiāng)改為人民公社，高級(jí)農(nóng)業(yè)合作社改為生產(chǎn)大隊(duì)。
是年11月，并入金川公社，為該公社寧遠(yuǎn)大隊(duì)山灣生產(chǎn)隊(duì)。
1961年金川公社撤銷，建立寧遠(yuǎn)堡公社，為寧遠(yuǎn)堡公社山灣大隊(duì)。
1968年改名紅星公社紅光大隊(duì)，1970年恢復(fù)原名。
1981年劃入金昌市屬寧遠(yuǎn)堡公社。
1983年政社分設(shè)改為寧遠(yuǎn)堡鄉(xiāng)山灣村村民委員會(huì)，轄4個(gè)村民小組，村委會(huì)駐地馬家山灣。
1984年屬金川區(qū)寧遠(yuǎn)堡鄉(xiāng)。
1999年12月撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，改為寧遠(yuǎn)堡鎮(zhèn)山灣村沿用至今。
2007年3月設(shè)立山灣村社區(qū)工作委員會(huì)。
2013年設(shè)立村務(wù)監(jiān)督委員會(huì)。
村民委員會(huì)、村社區(qū)工作委員會(huì)、村務(wù)監(jiān)督委員會(huì)一套人馬三塊牌子合署。