西晉太康三年(282年)從晉安縣析置同安縣（同安之名始此），是年復(fù)并入晉安縣。
隋為南安縣地。
唐貞元十九年(803年)析南安縣西南四鄉(xiāng)置大同場。
五代后唐長興四年（即933年，一說五代后唐天成四年929年，另說后晉天福四年939年），升大同場為同安縣，同安縣建制始此。
治所今大同街道，屬清源軍節(jié)度。
宋改清源軍為平海軍，仍屬之，為綏德鄉(xiāng)（同禾、民安、翔風(fēng)、嘉禾四里）、永豐鄉(xiāng)（長興、從順、感化、歸德四里）、明盛鄉(xiāng)（仁德、安仁、積善三里）。
元屬泉州路，明、清屬福建省泉州府。
清乾隆四十年(1775年)，析縣東境的翔風(fēng)里、民安里及同禾里五、六、七都置馬巷廳。
1912年馬巷廳廢，仍歸同安縣。
1913年析嘉禾里置思明縣。
1913年廢府州，屬南路道。
1914年屬廈門道，同年析翔風(fēng)里浯洲（金門島）、烈?guī)Z及大、小嶝島置金門縣。
1928年廢道，直屬福建省。
1934年屬駐泉州的第五行政督察區(qū)。
1935年屬第四行政督察區(qū)，1949年屬第五專區(qū)。
1950年屬泉州專區(qū)，同年9月改屬晉江專區(qū)。
1953年11月，集美鄉(xiāng)劃歸廈門市。
1957年西境灌口區(qū)錦宅鄉(xiāng)、金山鄉(xiāng)劃歸龍溪縣（今龍海市），灌口區(qū)其余12鄉(xiāng)劃歸廈門市。
1958年后至今為廈門市轄（1970—1973年曾回屬晉江地區(qū)）。
1996年11月同安撤縣設(shè)區(qū)。
2003年同安區(qū)析東部大嶝、馬巷、新圩、新店、內(nèi)厝5鎮(zhèn)置翔安區(qū)。