1949年前為上巖西鄉(xiāng)第九保轄。
1951年，改第九保分出置為農(nóng)家村，隸上巖西鄉(xiāng)。
1953年析上巖西鄉(xiāng)北西部置農(nóng)家鄉(xiāng)，村被劃屬。
1956年1月，廢農(nóng)家鄉(xiāng)入上巖西鄉(xiāng)，村復(fù)隸。
1958年，以境內(nèi)地名鹿井更名為為鹿井大隊(duì)。
屬上巖西人民公社。
1984年1月，改公社為鄉(xiāng)，鹿井大隊(duì)也同時(shí)改稱(chēng)為鹿井村，隸上巖西鄉(xiāng)，2001年，新建黃家鎮(zhèn)，上巖西鄉(xiāng)隸屬，村隨屬。
2003年村組調(diào)整時(shí)由原鹿井村、高橋村3組、巖嘴村6組組建為鹿井村，同時(shí)設(shè)立鹿井村村民委員會(huì)，隸屬黃家鎮(zhèn)，沿用至今。