李家墳村在中華人民共和國成立后建制成村。
村內有劉家墳、孫家墳、李家墳、白家墳四個小村落，先前均為附近村莊的莊頭墳戶，其中孫家墳、劉家墳屬南玉河村，李家墳、白家墳屬皂甲屯。
1954年底，在農業(yè)合作化運動中，村內四個小村落被整合為一個分社，后在人民公社化運動中又成為公社下的一個生產隊，并加入西郊農場，為西郊農場二分場（上莊公社二大隊）皂甲屯3隊。
1985年上級批復在原皂甲屯3隊基礎上成立李家墳村委會，李家墳村成為獨立村莊，但是在行政隸屬關系上仍屬西郊農場二分場（上莊村委會）下轄的自然村。
1998年西郊農場于上莊鄉(xiāng)場鄉(xiāng)分設，2001年李家墳村掛牌成立行政村級村委會，李家墳村升格成為中華人民共和國版圖內的一個基層行政村。